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[ginac.git] / doc / reference / DoxyfileHTML
index 2f38c39ce13e896de38b5b7c9876148d9e390397..0f5c484333a8b2729234f500dc80d661c739d9eb 100644 (file)
@@ -1,6 +1,7 @@
-# Doxyfile 1.2.5
+# Doxyfile 1.2.18
 
-# This file describes the settings to be used by doxygen for a project
+# This file describes the settings to be used by the documentation system
+# doxygen (www.doxygen.org) for a project
 #
 # All text after a hash (#) is considered a comment and will be ignored
 # The format is:
@@ -14,7 +15,7 @@
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # The PROJECT_NAME tag is a single word (or a sequence of words surrounded 
-# by quotes) that should identify the project. 
+# by quotes) that should identify the project.
 
 PROJECT_NAME           = GiNaC
 
@@ -29,73 +30,94 @@ PROJECT_NUMBER         =
 # If a relative path is entered, it will be relative to the location 
 # where doxygen was started. If left blank the current directory will be used.
 
-OUTPUT_DIRECTORY       = .
+OUTPUT_DIRECTORY       = 
 
 # The OUTPUT_LANGUAGE tag is used to specify the language in which all 
 # documentation generated by doxygen is written. Doxygen will use this 
 # information to generate all constant output in the proper language. 
 # The default language is English, other supported languages are: 
-# Dutch, French, Italian, Czech, Swedish, German, Finnish, Japanese, 
-# Korean, Hungarian, Norwegian, Spanish, Romanian, Russian, Croatian, 
-# Polish, Portuguese and Slovene.
+# Brazilian, Catalan, Chinese, Chinese-Traditional, Croatian, Czech, Danish, Dutch, 
+# Finnish, French, German, Greek, Hungarian, Italian, Japanese, Japanese-en 
+# (Japanese with english messages), Korean, Norwegian, Polish, Portuguese, 
+# Romanian, Russian, Serbian, Slovak, Slovene, Spanish, Swedish and Ukrainian.
 
 OUTPUT_LANGUAGE        = English
 
 # If the EXTRACT_ALL tag is set to YES doxygen will assume all entities in 
 # documentation are documented, even if no documentation was available. 
 # Private class members and static file members will be hidden unless 
-# the EXTRACT_PRIVATE and EXTRACT_STATIC tags are set to YES 
+# the EXTRACT_PRIVATE and EXTRACT_STATIC tags are set to YES
 
 EXTRACT_ALL            = YES
 
 # If the EXTRACT_PRIVATE tag is set to YES all private members of a class 
-# will be included in the documentation. 
+# will be included in the documentation.
 
 EXTRACT_PRIVATE        = YES
 
 # If the EXTRACT_STATIC tag is set to YES all static members of a file 
-# will be included in the documentation. 
+# will be included in the documentation.
 
 EXTRACT_STATIC         = YES
 
+# If the EXTRACT_LOCAL_CLASSES tag is set to YES classes (and structs) 
+# defined locally in source files will be included in the documentation. 
+# If set to NO only classes defined in header files are included.
+
+EXTRACT_LOCAL_CLASSES  = YES
+
 # If the HIDE_UNDOC_MEMBERS tag is set to YES, Doxygen will hide all 
 # undocumented members of documented classes, files or namespaces. 
 # If set to NO (the default) these members will be included in the 
 # various overviews, but no documentation section is generated. 
-# This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled. 
+# This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled.
 
 HIDE_UNDOC_MEMBERS     = NO
 
 # If the HIDE_UNDOC_CLASSES tag is set to YES, Doxygen will hide all 
 # undocumented classes that are normally visible in the class hierarchy. 
 # If set to NO (the default) these class will be included in the various 
-# overviews. This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled. 
+# overviews. This option has no effect if EXTRACT_ALL is enabled.
 
 HIDE_UNDOC_CLASSES     = NO
 
+# If the HIDE_FRIEND_COMPOUNDS tag is set to YES, Doxygen will hide all 
+# friend (class|struct|union) declarations. 
+# If set to NO (the default) these declarations will be included in the 
+# documentation.
+
+HIDE_FRIEND_COMPOUNDS  = NO
+
 # If the BRIEF_MEMBER_DESC tag is set to YES (the default) Doxygen will 
 # include brief member descriptions after the members that are listed in 
 # the file and class documentation (similar to JavaDoc). 
-# Set to NO to disable this. 
+# Set to NO to disable this.
 
 BRIEF_MEMBER_DESC      = YES
 
 # If the REPEAT_BRIEF tag is set to YES (the default) Doxygen will prepend 
 # the brief description of a member or function before the detailed description. 
 # Note: if both HIDE_UNDOC_MEMBERS and BRIEF_MEMBER_DESC are set to NO, the 
-# brief descriptions will be completely suppressed. 
+# brief descriptions will be completely suppressed.
 
 REPEAT_BRIEF           = YES
 
 # If the ALWAYS_DETAILED_SEC and REPEAT_BRIEF tags are both set to YES then 
 # Doxygen will generate a detailed section even if there is only a brief 
-# description. 
+# description.
 
 ALWAYS_DETAILED_SEC    = NO
 
+# If the INLINE_INHERITED_MEMB tag is set to YES, doxygen will show all inherited 
+# members of a class in the documentation of that class as if those members were 
+# ordinary class members. Constructors, destructors and assignment operators of 
+# the base classes will not be shown.
+
+INLINE_INHERITED_MEMB  = NO
+
 # If the FULL_PATH_NAMES tag is set to YES then Doxygen will prepend the full 
 # path before files name in the file list and in the header files. If set 
-# to NO the shortest path that makes the file name unique will be used. 
+# to NO the shortest path that makes the file name unique will be used.
 
 FULL_PATH_NAMES        = NO
 
@@ -109,29 +131,13 @@ STRIP_FROM_PATH        =
 # The INTERNAL_DOCS tag determines if documentation 
 # that is typed after a \internal command is included. If the tag is set 
 # to NO (the default) then the documentation will be excluded. 
-# Set it to YES to include the internal documentation. 
+# Set it to YES to include the internal documentation.
 
 INTERNAL_DOCS          = NO
 
-# If the CLASS_DIAGRAMS tag is set to YES (the default) Doxygen will 
-# generate a class diagram (in Html and LaTeX) for classes with base or 
-# super classes. Setting the tag to NO turns the diagrams off. 
-
-CLASS_DIAGRAMS         = YES
-
-# If the SOURCE_BROWSER tag is set to YES then a list of source files will 
-# be generated. Documented entities will be cross-referenced with these sources. 
-
-SOURCE_BROWSER         = YES
-
-# Setting the INLINE_SOURCES tag to YES will include the body 
-# of functions and classes directly in the documentation. 
-
-INLINE_SOURCES         = NO
-
 # Setting the STRIP_CODE_COMMENTS tag to YES (the default) will instruct 
 # doxygen to hide any special comment blocks from generated source code 
-# fragments. Normal C and C++ comments will always remain visible. 
+# fragments. Normal C and C++ comments will always remain visible.
 
 STRIP_CODE_COMMENTS    = YES
 
@@ -143,21 +149,27 @@ STRIP_CODE_COMMENTS    = YES
 
 CASE_SENSE_NAMES       = YES
 
+# If the SHORT_NAMES tag is set to YES, doxygen will generate much shorter 
+# (but less readable) file names. This can be useful is your file systems 
+# doesn't support long names like on DOS, Mac, or CD-ROM.
+
+SHORT_NAMES            = NO
+
 # If the HIDE_SCOPE_NAMES tag is set to NO (the default) then Doxygen 
 # will show members with their full class and namespace scopes in the 
-# documentation. If set to YES the scope will be hidden. 
+# documentation. If set to YES the scope will be hidden.
 
 HIDE_SCOPE_NAMES       = NO
 
 # If the VERBATIM_HEADERS tag is set to YES (the default) then Doxygen 
 # will generate a verbatim copy of the header file for each class for 
-# which an include is specified. Set to NO to disable this. 
+# which an include is specified. Set to NO to disable this.
 
 VERBATIM_HEADERS       = NO
 
 # If the SHOW_INCLUDE_FILES tag is set to YES (the default) then Doxygen 
 # will put list of the files that are included by a file in the documentation 
-# of that file. 
+# of that file.
 
 SHOW_INCLUDE_FILES     = YES
 
@@ -165,25 +177,40 @@ SHOW_INCLUDE_FILES     = YES
 # will interpret the first line (until the first dot) of a JavaDoc-style 
 # comment as the brief description. If set to NO, the JavaDoc 
 # comments  will behave just like the Qt-style comments (thus requiring an 
-# explict @brief command for a brief description. 
+# explict @brief command for a brief description.
 
 JAVADOC_AUTOBRIEF      = YES
 
+# The MULTILINE_CPP_IS_BRIEF tag can be set to YES to make Doxygen 
+# treat a multi-line C++ special comment block (i.e. a block of //! or /// 
+# comments) as a brief description. This used to be the default behaviour. 
+# The new default is to treat a multi-line C++ comment block as a detailed 
+# description. Set this tag to YES if you prefer the old behaviour instead.
+
+MULTILINE_CPP_IS_BRIEF = NO
+
+# If the DETAILS_AT_TOP tag is set to YES then Doxygen 
+# will output the detailed description near the top, like JavaDoc.
+# If set to NO, the detailed description appears after the member 
+# documentation.
+
+DETAILS_AT_TOP         = NO
+
 # If the INHERIT_DOCS tag is set to YES (the default) then an undocumented 
 # member inherits the documentation from any documented member that it 
-# reimplements. 
+# reimplements.
 
 INHERIT_DOCS           = YES
 
 # If the INLINE_INFO tag is set to YES (the default) then a tag [inline] 
-# is inserted in the documentation for inline members. 
+# is inserted in the documentation for inline members.
 
 INLINE_INFO            = YES
 
 # If the SORT_MEMBER_DOCS tag is set to YES (the default) then doxygen 
 # will sort the (detailed) documentation of file and class members 
 # alphabetically by member name. If set to NO the members will appear in 
-# declaration order. 
+# declaration order.
 
 SORT_MEMBER_DOCS       = NO
 
@@ -195,15 +222,10 @@ SORT_MEMBER_DOCS       = NO
 DISTRIBUTE_GROUP_DOC   = NO
 
 # The TAB_SIZE tag can be used to set the number of spaces in a tab. 
-# Doxygen uses this value to replace tabs by spaces in code fragments. 
+# Doxygen uses this value to replace tabs by spaces in code fragments.
 
 TAB_SIZE               = 4
 
-# The ENABLE_SECTIONS tag can be used to enable conditional 
-# documentation sections, marked by \if sectionname ... \endif. 
-
-ENABLED_SECTIONS       = 
-
 # The GENERATE_TODOLIST tag can be used to enable (YES) or 
 # disable (NO) the todo list. This list is created by putting \todo 
 # commands in the documentation.
@@ -216,63 +238,92 @@ GENERATE_TODOLIST      = NO
 
 GENERATE_TESTLIST      = NO
 
+# The GENERATE_BUGLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the bug list. This list is created by putting \bug 
+# commands in the documentation.
+
+GENERATE_BUGLIST       = NO
+
+# The GENERATE_DEPRECATEDLIST tag can be used to enable (YES) or 
+# disable (NO) the deprecated list. This list is created by putting \deprecated commands in the documentation.
+
+GENERATE_DEPRECATEDLIST= NO
+
 # This tag can be used to specify a number of aliases that acts 
 # as commands in the documentation. An alias has the form "name=value". 
 # For example adding "sideeffect=\par Side Effects:\n" will allow you to 
 # put the command \sideeffect (or @sideeffect) in the documentation, which 
 # will result in a user defined paragraph with heading "Side Effects:". 
-# You can put \n's in the value part of an alias to insert newlines. 
+# You can put \n's in the value part of an alias to insert newlines.
 
 ALIASES                = 
 
+# The ENABLED_SECTIONS tag can be used to enable conditional 
+# documentation sections, marked by \if sectionname ... \endif.
+
+ENABLED_SECTIONS       = 
+
 # The MAX_INITIALIZER_LINES tag determines the maximum number of lines 
 # the initial value of a variable or define consist of for it to appear in 
 # the documentation. If the initializer consists of more lines than specified 
 # here it will be hidden. Use a value of 0 to hide initializers completely. 
 # The appearance of the initializer of individual variables and defines in the 
 # documentation can be controlled using \showinitializer or \hideinitializer 
-# command in the documentation regardless of this setting. 
+# command in the documentation regardless of this setting.
 
 MAX_INITIALIZER_LINES  = 30
 
 # Set the OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C tag to YES if your project consists of C sources 
 # only. Doxygen will then generate output that is more tailored for C. 
 # For instance some of the names that are used will be different. The list 
-# of all members will be omitted, etc. 
+# of all members will be omitted, etc.
 
 OPTIMIZE_OUTPUT_FOR_C  = NO
 
+# Set the OPTIMIZE_OUTPUT_JAVA tag to YES if your project consists of Java sources 
+# only. Doxygen will then generate output that is more tailored for Java. 
+# For instance namespaces will be presented as packages, qualified scopes 
+# will look different, etc.
+
+OPTIMIZE_OUTPUT_JAVA   = NO
+
+# Set the SHOW_USED_FILES tag to NO to disable the list of files generated 
+# at the bottom of the documentation of classes and structs. If set to YES the 
+# list will mention the files that were used to generate the documentation.
+
+SHOW_USED_FILES        = YES
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # configuration options related to warning and progress messages
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # The QUIET tag can be used to turn on/off the messages that are generated 
-# by doxygen. Possible values are YES and NO. If left blank NO is used. 
+# by doxygen. Possible values are YES and NO. If left blank NO is used.
 
 QUIET                  = NO
 
 # The WARNINGS tag can be used to turn on/off the warning messages that are 
 # generated by doxygen. Possible values are YES and NO. If left blank 
-# NO is used. 
+# NO is used.
 
-WARNINGS               = YES
+WARNINGS               = NO
 
 # If WARN_IF_UNDOCUMENTED is set to YES, then doxygen will generate warnings 
 # for undocumented members. If EXTRACT_ALL is set to YES then this flag will 
-# automatically be disabled. 
+# automatically be disabled.
 
 WARN_IF_UNDOCUMENTED   = YES
 
 # The WARN_FORMAT tag determines the format of the warning messages that 
 # doxygen can produce. The string should contain the $file, $line, and $text 
 # tags, which will be replaced by the file and line number from which the 
-# warning originated and the warning text. 
+# warning originated and the warning text.
 
 WARN_FORMAT            = "$file:$line: $text"
 
 # The WARN_LOGFILE tag can be used to specify a file to which warning 
 # and error messages should be written. If left blank the output is written 
-# to stderr. 
+# to stderr.
 
 WARN_LOGFILE           = 
 
@@ -283,51 +334,65 @@ WARN_LOGFILE           =
 # The INPUT tag can be used to specify the files and/or directories that contain 
 # documented source files. You may enter file names like "myfile.cpp" or 
 # directories like "/usr/src/myproject". Separate the files or directories 
-# with spaces. 
+# with spaces.
 
 INPUT                  = ../../ginac
 
 # If the value of the INPUT tag contains directories, you can use the 
 # FILE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
 # and *.h) to filter out the source-files in the directories. If left 
-# blank all files are included. 
+# blank the following patterns are tested: 
+# *.c *.cc *.cxx *.cpp *.c++ *.java *.ii *.ixx *.ipp *.i++ *.inl *.h *.hh *.hxx *.hpp 
+# *.h++ *.idl *.odl
 
 FILE_PATTERNS          = *.cpp *.h
 
 # The RECURSIVE tag can be used to turn specify whether or not subdirectories 
 # should be searched for input files as well. Possible values are YES and NO. 
-# If left blank NO is used. 
+# If left blank NO is used.
 
 RECURSIVE              = NO
 
 # The EXCLUDE tag can be used to specify files and/or directories that should 
 # excluded from the INPUT source files. This way you can easily exclude a 
-# subdirectory from a directory tree whose root is specified with the INPUT tag. 
+# subdirectory from a directory tree whose root is specified with the INPUT tag.
 
 EXCLUDE                = 
 
+# The EXCLUDE_SYMLINKS tag can be used select whether or not files or directories 
+# that are symbolic links (a Unix filesystem feature) are excluded from the input.
+
+EXCLUDE_SYMLINKS       = NO
+
 # If the value of the INPUT tag contains directories, you can use the 
 # EXCLUDE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard patterns to exclude 
-# certain files from those directories. 
+# certain files from those directories.
 
 EXCLUDE_PATTERNS       = 
 
 # The EXAMPLE_PATH tag can be used to specify one or more files or 
 # directories that contain example code fragments that are included (see 
-# the \include command). 
+# the \include command).
 
 EXAMPLE_PATH           = 
 
 # If the value of the EXAMPLE_PATH tag contains directories, you can use the 
 # EXAMPLE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard pattern (like *.cpp 
 # and *.h) to filter out the source-files in the directories. If left 
-# blank all files are included. 
+# blank all files are included.
 
 EXAMPLE_PATTERNS       = 
 
+# If the EXAMPLE_RECURSIVE tag is set to YES then subdirectories will be 
+# searched for input files to be used with the \include or \dontinclude 
+# commands irrespective of the value of the RECURSIVE tag. 
+# Possible values are YES and NO. If left blank NO is used.
+
+EXAMPLE_RECURSIVE      = NO
+
 # The IMAGE_PATH tag can be used to specify one or more files or 
 # directories that contain image that are included in the documentation (see 
-# the \image command). 
+# the \image command).
 
 IMAGE_PATH             = 
 
@@ -336,36 +401,62 @@ IMAGE_PATH             =
 # by executing (via popen()) the command <filter> <input-file>, where <filter> 
 # is the value of the INPUT_FILTER tag, and <input-file> is the name of an 
 # input file. Doxygen will then use the output that the filter program writes 
-# to standard output. 
+# to standard output.
 
 INPUT_FILTER           = 
 
 # If the FILTER_SOURCE_FILES tag is set to YES, the input filter (if set using 
 # INPUT_FILTER) will be used to filter the input files when producing source 
-# files to browse
+# files to browse (i.e. when SOURCE_BROWSER is set to YES).
 
 FILTER_SOURCE_FILES    = NO
 
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to source browsing
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the SOURCE_BROWSER tag is set to YES then a list of source files will 
+# be generated. Documented entities will be cross-referenced with these sources.
+
+SOURCE_BROWSER         = YES
+
+# Setting the INLINE_SOURCES tag to YES will include the body 
+# of functions and classes directly in the documentation.
+
+INLINE_SOURCES         = NO
+
+# If the REFERENCED_BY_RELATION tag is set to YES (the default) 
+# then for each documented function all documented 
+# functions referencing it will be listed.
+
+REFERENCED_BY_RELATION = YES
+
+# If the REFERENCES_RELATION tag is set to YES (the default) 
+# then for each documented function all documented entities 
+# called/used by that function will be listed.
+
+REFERENCES_RELATION    = YES
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # configuration options related to the alphabetical class index
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the ALPHABETICAL_INDEX tag is set to YES, an alphabetical index 
 # of all compounds will be generated. Enable this if the project 
-# contains a lot of classes, structs, unions or interfaces. 
+# contains a lot of classes, structs, unions or interfaces.
 
 ALPHABETICAL_INDEX     = YES
 
 # If the alphabetical index is enabled (see ALPHABETICAL_INDEX) then 
 # the COLS_IN_ALPHA_INDEX tag can be used to specify the number of columns 
-# in which this list will be split (can be a number in the range [1..20]) 
+# in which this list will be split (can be a number in the range [1..20])
 
 COLS_IN_ALPHA_INDEX    = 5
 
 # In case all classes in a project start with a common prefix, all 
 # classes will be put under the same header in the alphabetical index. 
 # The IGNORE_PREFIX tag can be used to specify one or more prefixes that 
-# should be ignored while generating the index headers. 
+# should be ignored while generating the index headers.
 
 IGNORE_PREFIX          = 
 
@@ -374,16 +465,22 @@ IGNORE_PREFIX          =
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the GENERATE_HTML tag is set to YES (the default) Doxygen will 
-# generate HTML output. 
+# generate HTML output.
 
 GENERATE_HTML          = YES
 
 # The HTML_OUTPUT tag is used to specify where the HTML docs will be put. 
 # If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
-# put in front of it. If left blank `html' will be used as the default path. 
+# put in front of it. If left blank `html' will be used as the default path.
 
 HTML_OUTPUT            = .
 
+# The HTML_FILE_EXTENSION tag can be used to specify the file extension for 
+# each generated HTML page (for example: .htm,.php,.asp). If it is left blank 
+# doxygen will generate files with .html extension.
+
+HTML_FILE_EXTENSION    = .html
+
 # The HTML_HEADER tag can be used to specify a personal HTML header for 
 # each generated HTML page. If it is left blank doxygen will generate a 
 # standard header.
@@ -399,39 +496,72 @@ HTML_FOOTER            = Doxyfooter
 # The HTML_STYLESHEET tag can be used to specify a user defined cascading 
 # style sheet that is used by each HTML page. It can be used to 
 # fine-tune the look of the HTML output. If the tag is left blank doxygen 
-# will generate a default style sheet 
+# will generate a default style sheet
 
 HTML_STYLESHEET        = 
 
 # If the HTML_ALIGN_MEMBERS tag is set to YES, the members of classes, 
 # files or namespaces will be aligned in HTML using tables. If set to 
-# NO a bullet list will be used. 
+# NO a bullet list will be used.
 
 HTML_ALIGN_MEMBERS     = YES
 
 # If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, additional index files 
 # will be generated that can be used as input for tools like the 
 # Microsoft HTML help workshop to generate a compressed HTML help file (.chm) 
-# of the generated HTML documentation. 
+# of the generated HTML documentation.
 
 GENERATE_HTMLHELP      = NO
 
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the CHM_FILE tag can 
+# be used to specify the file name of the resulting .chm file. You 
+# can add a path in front of the file if the result should not be 
+# written to the html output dir.
+
+CHM_FILE               = 
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the HHC_LOCATION tag can 
+# be used to specify the location (absolute path including file name) of 
+# the HTML help compiler (hhc.exe). If non empty doxygen will try to run 
+# the html help compiler on the generated index.hhp.
+
+HHC_LOCATION           = 
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the GENERATE_CHI flag 
+# controls if a separate .chi index file is generated (YES) or that 
+# it should be included in the master .chm file (NO).
+
+GENERATE_CHI           = NO
+
+# If the GENERATE_HTMLHELP tag is set to YES, the BINARY_TOC flag 
+# controls whether a binary table of contents is generated (YES) or a 
+# normal table of contents (NO) in the .chm file.
+
+BINARY_TOC             = NO
+
+# The TOC_EXPAND flag can be set to YES to add extra items for group members 
+# to the contents of the Html help documentation and to the tree view.
+
+TOC_EXPAND             = NO
+
 # The DISABLE_INDEX tag can be used to turn on/off the condensed index at 
 # top of each HTML page. The value NO (the default) enables the index and 
-# the value YES disables it. 
+# the value YES disables it.
 
 DISABLE_INDEX          = NO
 
 # This tag can be used to set the number of enum values (range [1..20]) 
-# that doxygen will group on one line in the generated HTML documentation. 
+# that doxygen will group on one line in the generated HTML documentation.
 
-ENUM_VALUES_PER_LINE   = 2
+ENUM_VALUES_PER_LINE   = 4
 
 # If the GENERATE_TREEVIEW tag is set to YES, a side panel will be
 # generated containing a tree-like index structure (just like the one that 
 # is generated for HTML Help). For this to work a browser that supports 
-# JavaScript and frames is required (for instance Netscape 4.0+ 
-# or Internet explorer 4.0+). 
+# JavaScript and frames is required (for instance Mozilla, Netscape 4.0+, 
+# or Internet explorer 4.0+). Note that for large projects the tree generation 
+# can take a very long time. In such cases it is better to disable this feature. 
+# Windows users are probably better off using the HTML help feature.
 
 GENERATE_TREEVIEW      = NO
 
@@ -446,57 +576,67 @@ TREEVIEW_WIDTH         = 250
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the GENERATE_LATEX tag is set to YES (the default) Doxygen will 
-# generate Latex output. 
+# generate Latex output.
 
 GENERATE_LATEX         = NO
 
 # The LATEX_OUTPUT tag is used to specify where the LaTeX docs will be put. 
 # If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
-# put in front of it. If left blank `latex' will be used as the default path. 
+# put in front of it. If left blank `latex' will be used as the default path.
 
 LATEX_OUTPUT           = latex
 
+# The LATEX_CMD_NAME tag can be used to specify the LaTeX command name to be invoked. If left blank `latex' will be used as the default command name.
+
+LATEX_CMD_NAME         = latex
+
+# The MAKEINDEX_CMD_NAME tag can be used to specify the command name to 
+# generate index for LaTeX. If left blank `makeindex' will be used as the 
+# default command name.
+
+MAKEINDEX_CMD_NAME     = makeindex
+
 # If the COMPACT_LATEX tag is set to YES Doxygen generates more compact 
 # LaTeX documents. This may be useful for small projects and may help to 
-# save some trees in general. 
+# save some trees in general.
 
 COMPACT_LATEX          = NO
 
 # The PAPER_TYPE tag can be used to set the paper type that is used 
 # by the printer. Possible values are: a4, a4wide, letter, legal and 
-# executive. If left blank a4wide will be used. 
+# executive. If left blank a4wide will be used.
 
 PAPER_TYPE             = a4wide
 
 # The EXTRA_PACKAGES tag can be to specify one or more names of LaTeX 
-# packages that should be included in the LaTeX output. 
+# packages that should be included in the LaTeX output.
 
 EXTRA_PACKAGES         = 
 
 # The LATEX_HEADER tag can be used to specify a personal LaTeX header for 
 # the generated latex document. The header should contain everything until 
 # the first chapter. If it is left blank doxygen will generate a 
-# standard header. Notice: only use this tag if you know what you are doing! 
+# standard header. Notice: only use this tag if you know what you are doing!
 
 LATEX_HEADER           = 
 
 # If the PDF_HYPERLINKS tag is set to YES, the LaTeX that is generated 
 # is prepared for conversion to pdf (using ps2pdf). The pdf file will 
 # contain links (just like the HTML output) instead of page references 
-# This makes the output suitable for online browsing using a pdf viewer. 
+# This makes the output suitable for online browsing using a pdf viewer.
 
 PDF_HYPERLINKS         = NO
 
 # If the USE_PDFLATEX tag is set to YES, pdflatex will be used instead of 
 # plain latex in the generated Makefile. Set this option to YES to get a 
-# higher quality PDF documentation. 
+# higher quality PDF documentation.
 
 USE_PDFLATEX           = NO
 
 # If the LATEX_BATCHMODE tag is set to YES, doxygen will add the \\batchmode. 
 # command to the generated LaTeX files. This will instruct LaTeX to keep 
 # running if errors occur, instead of asking the user for help. 
-# This option is also used when generating formulas in HTML. 
+# This option is also used when generating formulas in HTML.
 
 LATEX_BATCHMODE        = NO
 
@@ -512,128 +652,192 @@ GENERATE_RTF           = NO
 
 # The RTF_OUTPUT tag is used to specify where the RTF docs will be put. 
 # If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
-# put in front of it. If left blank `rtf' will be used as the default path. 
+# put in front of it. If left blank `rtf' will be used as the default path.
 
 RTF_OUTPUT             = rtf
 
 # If the COMPACT_RTF tag is set to YES Doxygen generates more compact 
 # RTF documents. This may be useful for small projects and may help to 
-# save some trees in general. 
+# save some trees in general.
 
 COMPACT_RTF            = NO
 
 # If the RTF_HYPERLINKS tag is set to YES, the RTF that is generated 
 # will contain hyperlink fields. The RTF file will 
 # contain links (just like the HTML output) instead of page references. 
-# This makes the output suitable for online browsing using a WORD or other. 
+# This makes the output suitable for online browsing using WORD or other 
 # programs which support those fields. 
-# Note: wordpad (write) and others do not support links. 
+# Note: wordpad (write) and others do not support links.
 
 RTF_HYPERLINKS         = NO
 
 # Load stylesheet definitions from file. Syntax is similar to doxygen's 
 # config file, i.e. a series of assigments. You only have to provide 
-# replacements, missing definitions are set to their default value. 
+# replacements, missing definitions are set to their default value.
 
 RTF_STYLESHEET_FILE    = 
 
+# Set optional variables used in the generation of an rtf document. 
+# Syntax is similar to doxygen's config file.
+
+RTF_EXTENSIONS_FILE    = 
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # configuration options related to the man page output
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the GENERATE_MAN tag is set to YES (the default) Doxygen will 
-# generate man pages 
+# generate man pages
 
 GENERATE_MAN           = NO
 
 # The MAN_OUTPUT tag is used to specify where the man pages will be put. 
 # If a relative path is entered the value of OUTPUT_DIRECTORY will be 
-# put in front of it. If left blank `man' will be used as the default path. 
+# put in front of it. If left blank `man' will be used as the default path.
 
 MAN_OUTPUT             = man
 
 # The MAN_EXTENSION tag determines the extension that is added to 
-# the generated man pages (default is the subroutine's section .3) 
+# the generated man pages (default is the subroutine's section .3)
 
 MAN_EXTENSION          = .3
 
+# If the MAN_LINKS tag is set to YES and Doxygen generates man output, 
+# then it will generate one additional man file for each entity 
+# documented in the real man page(s). These additional files 
+# only source the real man page, but without them the man command 
+# would be unable to find the correct page. The default is NO.
+
+MAN_LINKS              = NO
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options related to the XML output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_XML tag is set to YES Doxygen will 
+# generate an XML file that captures the structure of 
+# the code including all documentation. Note that this 
+# feature is still experimental and incomplete at the 
+# moment.
+
+GENERATE_XML           = NO
+
+# The XML_SCHEMA tag can be used to specify an XML schema, 
+# which can be used by a validating XML parser to check the 
+# syntax of the XML files.
+
+XML_SCHEMA             = 
+
+# The XML_DTD tag can be used to specify an XML DTD, 
+# which can be used by a validating XML parser to check the 
+# syntax of the XML files.
+
+XML_DTD                = 
+
+#---------------------------------------------------------------------------
+# configuration options for the AutoGen Definitions output
+#---------------------------------------------------------------------------
+
+# If the GENERATE_AUTOGEN_DEF tag is set to YES Doxygen will 
+# generate an AutoGen Definitions (see autogen.sf.net) file 
+# that captures the structure of the code including all 
+# documentation. Note that this feature is still experimental 
+# and incomplete at the moment.
+
+GENERATE_AUTOGEN_DEF   = NO
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # Configuration options related to the preprocessor   
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # If the ENABLE_PREPROCESSING tag is set to YES (the default) Doxygen will 
 # evaluate all C-preprocessor directives found in the sources and include 
-# files. 
+# files.
 
 ENABLE_PREPROCESSING   = YES
 
 # If the MACRO_EXPANSION tag is set to YES Doxygen will expand all macro 
 # names in the source code. If set to NO (the default) only conditional 
 # compilation will be performed. Macro expansion can be done in a controlled 
-# way by setting EXPAND_ONLY_PREDEF to YES. 
+# way by setting EXPAND_ONLY_PREDEF to YES.
 
-MACRO_EXPANSION        = NO
+MACRO_EXPANSION        = YES
 
 # If the EXPAND_ONLY_PREDEF and MACRO_EXPANSION tags are both set to YES 
 # then the macro expansion is limited to the macros specified with the 
-# PREDEFINED and EXPAND_AS_PREDEFINED tags. 
+# PREDEFINED and EXPAND_AS_PREDEFINED tags.
 
-EXPAND_ONLY_PREDEF     = NO
+EXPAND_ONLY_PREDEF     = YES
 
 # If the SEARCH_INCLUDES tag is set to YES (the default) the includes files 
-# in the INCLUDE_PATH (see below) will be search if a #include is found. 
+# in the INCLUDE_PATH (see below) will be search if a #include is found.
 
 SEARCH_INCLUDES        = YES
 
 # The INCLUDE_PATH tag can be used to specify one or more directories that 
 # contain include files that are not input files but should be processed by 
-# the preprocessor. 
+# the preprocessor.
 
 INCLUDE_PATH           = 
 
 # You can use the INCLUDE_FILE_PATTERNS tag to specify one or more wildcard 
 # patterns (like *.h and *.hpp) to filter out the header-files in the 
 # directories. If left blank, the patterns specified with FILE_PATTERNS will 
-# be used. 
+# be used.
 
-INCLUDE_FILE_PATTERNS = *.h
+INCLUDE_FILE_PATTERNS  = *.h
 
 # The PREDEFINED tag can be used to specify one or more macro names that 
 # are defined before the preprocessor is started (similar to the -D option of 
 # gcc). The argument of the tag is a list of macros of the form: name 
 # or name=definition (no spaces). If the definition and the = are 
-# omitted =1 is assumed. 
+# omitted =1 is assumed.
 
-PREDEFINED             = 
+PREDEFINED             = "GINAC_DECLARE_REGISTERED_CLASS_NO_CTORS(class, base)=" \
+                         "GINAC_DECLARE_REGISTERED_CLASS(class, base)="
 
 # If the MACRO_EXPANSION and EXPAND_PREDEF_ONLY tags are set to YES then 
 # this tag can be used to specify a list of macro names that should be expanded. 
 # The macro definition that is found in the sources will be used. 
-# Use the PREDEFINED tag if you want to use a different macro definition. 
+# Use the PREDEFINED tag if you want to use a different macro definition.
 
 EXPAND_AS_DEFINED      = 
 
+# If the SKIP_FUNCTION_MACROS tag is set to YES (the default) then 
+# doxygen's preprocessor will remove all function-like macros that are alone 
+# on a line, have an all uppercase name, and do not end with a semicolon. Such 
+# function macros are typically used for boiler-plate code, and will confuse the 
+# parser if not removed.
+
+SKIP_FUNCTION_MACROS   = YES
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # Configuration::addtions related to external references   
 #---------------------------------------------------------------------------
 
-# The TAGFILES tag can be used to specify one or more tagfiles. 
+# The TAGFILES tag can be used to specify one or more tagfiles.
 
 TAGFILES               = 
 
 # When a file name is specified after GENERATE_TAGFILE, doxygen will create 
-# a tag file that is based on the input files it reads. 
+# a tag file that is based on the input files it reads.
 
 GENERATE_TAGFILE       = 
 
 # If the ALLEXTERNALS tag is set to YES all external classes will be listed 
 # in the class index. If set to NO only the inherited external classes 
-# will be listed. 
+# will be listed.
 
 ALLEXTERNALS           = NO
 
+# If the EXTERNAL_GROUPS tag is set to YES all external groups will be listed 
+# in the modules index. If set to NO, only the current project's groups will 
+# be listed.
+
+EXTERNAL_GROUPS        = YES
+
 # The PERL_PATH should be the absolute path and name of the perl script 
-# interpreter (i.e. the result of `which perl'). 
+# interpreter (i.e. the result of `which perl').
 
 PERL_PATH              = /usr/bin/perl
 
@@ -641,10 +845,24 @@ PERL_PATH              = /usr/bin/perl
 # Configuration options related to the dot tool   
 #---------------------------------------------------------------------------
 
+# If the CLASS_DIAGRAMS tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# generate a inheritance diagram (in Html, RTF and LaTeX) for classes with base or 
+# super classes. Setting the tag to NO turns the diagrams off. Note that this 
+# option is superceded by the HAVE_DOT option below. This is only a fallback. It is 
+# recommended to install and use dot, since it yield more powerful graphs.
+
+CLASS_DIAGRAMS         = YES
+
+# If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will hide 
+# inheritance and usage relations if the target is undocumented 
+# or is not a class.
+
+HIDE_UNDOC_RELATIONS   = YES
+
 # If you set the HAVE_DOT tag to YES then doxygen will assume the dot tool is 
 # available from the path. This tool is part of Graphviz, a graph visualization 
 # toolkit from AT&T and Lucent Bell Labs. The other options in this section 
-# have no effect if this option is set to NO (the default) 
+# have no effect if this option is set to NO (the default)
 
 HAVE_DOT               = NO
 
@@ -658,38 +876,56 @@ CLASS_GRAPH            = YES
 # If the COLLABORATION_GRAPH and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
 # will generate a graph for each documented class showing the direct and 
 # indirect implementation dependencies (inheritance, containment, and 
-# class references variables) of the class with other documented classes. 
+# class references variables) of the class with other documented classes.
 
 COLLABORATION_GRAPH    = YES
 
-# If the ENABLE_PREPROCESSING, INCLUDE_GRAPH, and HAVE_DOT tags are set to 
-# YES then doxygen will generate a graph for each documented file showing 
-# the direct and indirect include dependencies of the file with other 
-# documented files. 
+# If set to YES, the inheritance and collaboration graphs will show the 
+# relations between templates and their instances.
+
+TEMPLATE_RELATIONS     = YES
+
+# If the ENABLE_PREPROCESSING, SEARCH_INCLUDES, INCLUDE_GRAPH, and HAVE_DOT 
+# tags are set to YES then doxygen will generate a graph for each documented 
+# file showing the direct and indirect include dependencies of the file with 
+# other documented files.
 
 INCLUDE_GRAPH          = YES
 
-# If the ENABLE_PREPROCESSING, INCLUDED_BY_GRAPH, and HAVE_DOT tags are set to 
-# YES then doxygen will generate a graph for each documented header file showing 
-# the documented files that directly or indirectly include this file 
+# If the ENABLE_PREPROCESSING, SEARCH_INCLUDES, INCLUDED_BY_GRAPH, and 
+# HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen will generate a graph for each 
+# documented header file showing the documented files that directly or 
+# indirectly include this file.
 
 INCLUDED_BY_GRAPH      = YES
 
 # If the GRAPHICAL_HIERARCHY and HAVE_DOT tags are set to YES then doxygen 
-# will graphical hierarchy of all classes instead of a textual one. 
+# will graphical hierarchy of all classes instead of a textual one.
 
 GRAPHICAL_HIERARCHY    = YES
 
+# The DOT_IMAGE_FORMAT tag can be used to set the image format of the images 
+# generated by dot. Possible values are png, jpg, or gif
+# If left blank png will be used.
+
+DOT_IMAGE_FORMAT       = png
+
 # The tag DOT_PATH can be used to specify the path where the dot tool can be 
-# found. If left blank, it is assumed the dot tool can be found on the path. 
+# found. If left blank, it is assumed the dot tool can be found on the path.
 
 DOT_PATH               = 
 
+# The DOTFILE_DIRS tag can be used to specify one or more directories that 
+# contain dot files that are included in the documentation (see the 
+# \dotfile command).
+
+DOTFILE_DIRS           = 
+
 # The MAX_DOT_GRAPH_WIDTH tag can be used to set the maximum allowed width 
 # (in pixels) of the graphs generated by dot. If a graph becomes larger than 
 # this value, doxygen will try to truncate the graph, so that it fits within 
 # the specified constraint. Beware that most browsers cannot cope with very 
-# large images. 
+# large images.
 
 MAX_DOT_GRAPH_WIDTH    = 1024
 
@@ -697,56 +933,62 @@ MAX_DOT_GRAPH_WIDTH    = 1024
 # (in pixels) of the graphs generated by dot. If a graph becomes larger than 
 # this value, doxygen will try to truncate the graph, so that it fits within 
 # the specified constraint. Beware that most browsers cannot cope with very 
-# large images. 
+# large images.
 
 MAX_DOT_GRAPH_HEIGHT   = 1024
 
 # If the GENERATE_LEGEND tag is set to YES (the default) Doxygen will 
 # generate a legend page explaining the meaning of the various boxes and 
-# arrows in the dot generated graphs. 
+# arrows in the dot generated graphs.
 
 GENERATE_LEGEND        = YES
 
+# If the DOT_CLEANUP tag is set to YES (the default) Doxygen will 
+# remove the intermedate dot files that are used to generate 
+# the various graphs.
+
+DOT_CLEANUP            = YES
+
 #---------------------------------------------------------------------------
 # Configuration::addtions related to the search engine   
 #---------------------------------------------------------------------------
 
 # The SEARCHENGINE tag specifies whether or not a search engine should be 
-# used. If set to NO the values of all tags below this one will be ignored. 
+# used. If set to NO the values of all tags below this one will be ignored.
 
 SEARCHENGINE           = NO
 
 # The CGI_NAME tag should be the name of the CGI script that 
 # starts the search engine (doxysearch) with the correct parameters. 
-# A script with this name will be generated by doxygen. 
+# A script with this name will be generated by doxygen.
 
 CGI_NAME               = search.cgi
 
 # The CGI_URL tag should be the absolute URL to the directory where the 
 # cgi binaries are located. See the documentation of your http daemon for 
-# details. 
+# details.
 
 CGI_URL                = 
 
 # The DOC_URL tag should be the absolute URL to the directory where the 
 # documentation is located. If left blank the absolute path to the 
-# documentation, with file:// prepended to it, will be used. 
+# documentation, with file:// prepended to it, will be used.
 
 DOC_URL                = 
 
 # The DOC_ABSPATH tag should be the absolute path to the directory where the 
 # documentation is located. If left blank the directory on the local machine 
-# will be used. 
+# will be used.
 
 DOC_ABSPATH            = 
 
 # The BIN_ABSPATH tag must point to the directory where the doxysearch binary 
-# is installed. 
+# is installed.
 
-BIN_ABSPATH            = /usr/local/bin/
+BIN_ABSPATH            = /usr/bin/
 
 # The EXT_DOC_PATHS tag can be used to specify one or more paths to 
 # documentation generated for other projects. This allows doxysearch to search 
-# the documentation for these projects as well. 
+# the documentation for these projects as well.
 
 EXT_DOC_PATHS          =